НОВОСТЬ · RESEARCH · #151
Fraglingo: авторегрессная генерация фрагментов с учётом точки присоединения для проектирования молекул
В препринте представлен Fraglingo — авторегрессная модель для пофрагментного проектирования молекул, которая совместно моделирует идентичность фрагмента и способ его присоединения в непрерывном латентном пространстве. Модель использует «wildcard-anchored readout» для кодирования контекста точки присоединения, предсказывает вложение фрагмента с учётом присоединения, выбирает фрагмент поиском ближайшего соседа в латентном пространстве и демонстрирует лучшее совместное управление свойствами при сопоставимой валидности, уникальности и новизне, а также обобщается на словари фрагментов до 4× больше, чем при обучении.
КЛЮЧЕВЫЕ ТЕЗИСЫ
- В препринте представлен Fraglingo — авторегрессная модель для пофрагментного проектирования молекул, которая совместно моделирует идентичность фрагмента и способ его присоединения в непрерывном латентном пространстве.
- Модель использует «wildcard-anchored readout» для кодирования контекста точки присоединения, предсказывает вложение фрагмента с учётом присоединения, выбирает фрагмент поиском ближайшего соседа в латентном пространстве и демонстрирует лучшее совместное управление свойствами при сопоставимой валидности, уникальности и новизне, а также обобщается на словари фрагментов до 4× больше, чем при обучении.
- Совместное моделирование идентичности фрагмента и способа присоединения в непрерывном пространстве позволяет Fraglingo лучше соответствовать рабочему процессу химиков и добавлять новые фрагменты на этапе вывода без дообучения, повышая гибкость и масштабируемость поиска молекул.
ПОЧЕМУ ЭТО ВАЖНО
Совместное моделирование идентичности фрагмента и способа присоединения в непрерывном пространстве позволяет Fraglingo лучше соответствовать рабочему процессу химиков и добавлять новые фрагменты на этапе вывода без дообучения, повышая гибкость и масштабируемость поиска молекул.